Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cngb3Q9JJZ9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms