Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms