Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp19Q9JHI0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp19Q9JHI0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms