Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim39Q9ESN2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim39Q9ESN2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms