Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtofQ9ESF1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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