Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spock2Q9ER58 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spock2Q9ER58 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms