Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms