Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trmt112Q9DCG9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trmt112Q9DCG9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms