Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf6Q9DBU5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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