Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms