Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pop5Q9DB28 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms