Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc89Q9DA73 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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