Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cnot8Q9D8X5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot8Q9D8X5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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