Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms