Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifi35Q9D8C4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifi35Q9D8C4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms