Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D7E4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms