Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms