Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Borcs6Q9D6W8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Borcs6Q9D6W8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms