Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms