Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Phf6Q9D4J7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Phf6Q9D4J7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Phf6Q9D4J7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Phf6Q9D4J7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phf6Q9D4J7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phf6Q9D4J7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phf6Q9D4J7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phf6Q9D4J7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phf6Q9D4J7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf6Q9D4J7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms