Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms