Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx29Q9D3S3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Snx29Q9D3S3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx29Q9D3S3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx29Q9D3S3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx29Q9D3S3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx29Q9D3S3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx29Q9D3S3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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