Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms