Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hddc3Q9D114 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc3Q9D114 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms