Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Exosc7Q9D0M0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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