Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc47Q9D024 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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