Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis18aQ9CZJ6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis18aQ9CZJ6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis18aQ9CZJ6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis18aQ9CZJ6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis18aQ9CZJ6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms