Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms