Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RpainQ9CWY9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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