Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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