Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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MINDY3Q9CV28 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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MINDY3Q9CV28 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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