Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lhfpl3Q9CTN8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms