Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms