Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smim8Q9CQQ0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim8Q9CQQ0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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