Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl35Q9CQL6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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