Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms