Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms