Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rab5aQ9CQD1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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