Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms