Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NenfQ9CQ45 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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NenfQ9CQ45 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NenfQ9CQ45 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms