Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dph6Q9CQ28 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dph6Q9CQ28 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms