Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms