Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl27Q99N92 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms