Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms