Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nus1Q99LJ8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nus1Q99LJ8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms