Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ciao1Q99KN2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms