Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms