Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps4Q99KG7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms