Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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