Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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